>セルにプラスミドを添加して一定時間放置した後、MTTアッセイによりセルの数を定量した、ということなのでしょうか?
私は化学初心者でバイオにも疎く、このIC50の意味がわかりません。化学大辞典なども調べましたが、見当たりませんでした。何が50%で、何が阻害されるのか教えてください。できれば、MTT assayについても教えていただければ幸いです。, MiJunです。
とある物質の酵素阻害活性を測定しているのですが、
上記2点についてよろしくお願いします。, 「意味 文献」に関するQ&A: 引用・参考文献にある数字の意味がわかりません, 「意味 ML」に関するQ&A: リットル・デシリットル・ミリリットルの計算方法教えて下さい, 「IC50」に関するQ&A: 伊勢から東京方面 伊勢湾フェリーと高速どっちが早い, 「参考文献 意味」に関するQ&A: 吉野家の「株主優待の為だけ」に株を購入したいのですが, ホームセキュリティのプロが、家庭の防犯対策を真剣に考える 2組のご夫婦へ実際の防犯対策術をご紹介!どうすれば家と家族を守れるのかを教えます!, IC50(50%阻害濃度)の出し方についてご教示ください。
どのくらいの量の酵素に阻害剤を加え、
相関係数においても相関の有無を結論つけるにはそのrが偶然出る確率を出すか、5%の確率ならrがどれぐらいの値が出るかを知っておく必要が有ります。
濃度軸で見た場合の誤差は少なくなります。
わかりやすいかもしれません。
恐らくtransfectする際に各種のポリマー添加した場合に、添加ポリマーの毒性(?)(あるいはtransfectの手法?)で死滅する細胞があるのでしょう・・・?
å°åºã®ããã®3ã¹ãããã«ã¤ãã¦åããããã解説 ; åè¡¡äºç®ä¹æ°ã¨ã¯ï¼æ±ãæ¹ã«ã¤ãã¦ã解説 真ん中が5、左から1/10が1になるので、右半分は殆どデータがなく左側にばかりデータ点が並ぶことになります ãã£ã¨ããããããã æ©ç¨®ãé¸ã³ããããã¾ãã®ã§ã ãã²ãã²ãã確èªãã ããï¼ ææ¥ã 12æ26æ¥ã¯ã 10æéåºãã«ã¿ã¤ã å¶æ¥ã§ãï¼ï¼ï¼ 御足ãã¨ãæªããã¨ãäºæ¸¬ããã¾ãã ãæ°ãã¤ãã¦ãæ¥åºä¸ã ⦠簡単なことなのかもしれませんが、
誰ã§ãåãããããæ ªã«å¯¾ããç¥èã身ã«ã¤ãããã¾ãï¼ ããã«ãå人æè³å®¶ã¨ãã¦ãæ´»èºããå°å±ã¢ããªã¹ãããåç»ã§åå¿è
ã«ããããããããã¦ãã¦ãè§£èª¬ï¼ 反応速度が小さいと言うことは、基質との親和性が小さいということを意味します。, 相関係数についてくるP値の意味がわかりません。
EC50は活性実験で用いる、とありました。 (反応生成物を比色法で測定しています)
あとは、10倍では飛びすぎているので、間の点として5を選んだということで、それぞれの間に5x10^nのデータが並びます これは、2次蒸留水以上の純度があれば十分です。2次蒸留水、MilliQ水、超純水が使用できます。
それぞれの阻害率を求めて、エクセルで検量線を作って
・0.01→1.0E-2(1.0×1/10の2乗)→×1/100倍→÷100
1.酵素、基質、阻害物質を加え反応させて吸光度を測定
もっと簡単な方法があるかも知れませんが、私ならこう計算します。(アドインの分析ツールを使う以外は), pは確率(probability)のpです。全く相関のない数字を組み合わせたときにそのr値が出る確率をあらわしています。
お客様の許可なしに外部サービスに投稿することはございませんのでご安心ください。, ある酵素について、種々の基質濃度において、阻害剤の存在下および非存在下での酵素活性を測定したところ、. 以ä¸ã®ãããªã¤ã¡ã¼ã¸ã§ãã.
・10→1.0E+1(1.0×10の1乗)→×10倍
)という物質を加えて生育状況を見た、と書いてあります。
・100→1.0E+2(1.0×10の2乗)→×100倍
ここでnは組みデータの数です。((x1,y1),(x2,y2),・・・(xn,yn))
・10→1.0E+1(1.0×10の1乗)→×10倍
>r=0.90 (P<0.001)
ãããããã ç¾ä½å»ºé ç©çæ¾ç«ãéç¾ä½å»ºé ç©çæ¾ç«ã®ç¯ç½ªãããç®çã§ãå®è¡ãããã«æºåè¡çºããã人ã¯ã2年以ä¸ã®æ²å½¹ã«å¦ããã ãã ããäºæ
ã«ãã£ã¦ã¯ããã®åãå
é¤ãããã¨ãã§ããã バイオ・生化学関係に用いられる水は水道水をプレフィルターを通し、イオン交換・蒸留・逆浸透法、限外濾過などを複数回組み合わせて生成します。
で標本データの時はSTDEVを使って、母集団の時はSTDEVPをつかうことになります。
spssã¯ãibm社ã製é ã»è²©å£²ãã¦ããçµ±è¨è§£æã½ããã¦ã§ã¢ã§ããspssã®æ´å²ã¯é常ã«å¤ãã1968å¹´ã«ã¢ã¡ãªã«ã§èªçãã¾ããã大å¦é¢ã®å士課ç¨ã§ãã£ããã¼ãã³ã»ãã¤ããã©ã«ãã»ãã«ãã¯ããã¨ããå¦çãä½ã£ãçµ±è¨ããã°ã©ã ããããspssã§ããå®ã«50å¹´åã«ç£å£°ããããspssã
限外濾過法は限外濾過膜を通す方法です。孔径は半透膜が数十nmに対し、限外濾過膜は数nmです。それゆえ、数kDa以上の分子であれば、限外濾過法で除けますので、エンドトキシンやRNaseなども除去できます。本当にエンドトキシンフリーな水が必要でしたら限外濾過法を行った水が必須です。ただ、普通のCOSとかHEKとかの動物細胞培養でしたら2次蒸留水でも十分です。蛍光検出用のマイクロアレイなんかは限外濾過水が必須なようです。
正直、数学が苦手でして対数にする意味などはさっぱりです…
1 ãã«ã¨ãªã¹ã»ã¡ã³ãã³å¼ã®å°åº. 動物細胞培養用に使う場合はどの水を選べばよいのでしょうか?
次にそのr値をt値に変換します。
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ç¹å¥æ§é¤ãã¯2018å¹´ã«ã©ãå¤ãã£ãã®ãããããããã解説!
ç®æ¬¡. また、回帰分析の数字の意味が良く分からないのですが、
・『指数』って分かりますか?
自信はないですが、 Km値が大きくなるほど、親和性が上がるということでしょうか。 P=0.05で相関がない
最後に関数TDISTで確率に変換します。両側です。
質問させていただきました。 IC50値の出し方がいまいちわかりません。
補足:
ã¾ãã¢ãã ã»ã¹ãã¹ã¯ã輸åºå¥¨å±éå¶åº¦ãã¯å½ãè²§ããããã¨æ¹å¤ãã¦ãã¾ãã
æ®éã¯ã ããED50ï¼effective dose 50%ï¼ã¨ 表ãã¾ ãã. ((対照-サンプル)/対照)×100
EC50は50%効果濃度を求める、 それが危険率です。(この場合はp=0.1%でもいいと思いますが)
とある物質の酵素阻害活性を測定しているのですが、
統計・確率には100%言い切れることはまずありません。というか100%言い切れるのなら統計・確率を使う必要は有りません。
一方、もし90%で評価しようとすると、傾きが小さくなっているため、
IC50は何らかの阻害濃度を求めるときに用いるのだな、 ミカエリスメンテンのグラフからはKm値が小さくなるほうが、親和性が上がる気がするのですが。 1.酵素、基質、阻害物質を加え反応させて吸光度を測定
2.43×1/(10の19乗)で、
EC50と何が違うのか では、STDEVとSTDEVPの違いは何なのでしょうか?統計のことは疎く、お手数ですが、サルにもわかるようご教授頂きたく、お願い致します。, データが母集団そのものからとったか、標本データかで違います。また母集団そのものだったとしても(例えばクラス全員というような)、その背景にさらならる母集団(例えば学年全体)を想定して比較するような時もありますので、その場合は標本となります。
Km値は基質に対する酵素の親和性だと習いました。
また、実験内容によってはエンドトキシンを気にする実験もありますが、エンドトキシンフリーの水を使う場合はどれを選べばよいのでしょうか?
・0.1→1.0E-1(1.0×1/10の1乗)→×1/10倍→÷10
教えてください。
また、まったく別のことなんですが、
という風に行っていました。
私は現在、大学の実験で ã¨å¼ã³ã¾ãã. (例)
ãªã©ãã¯ã¹æ³å¦é¨ > åå¦è
ã®é¨å± > æ ¹æµå½æ¨©ã¨ã¯ï¼ããããããç°¡åã«è§£èª¬ãã¾ãã æ ¹æµå½æ¨©ï¼ãã¦ãã¨ãããï¼ã¨ã¯ã å売ãã... æ³å®å°ä¸æ¨©ããããããã ⦠試é¨åç©ã試é¨ç´°èã®åæ°ã«ç®çã®è¬çä½ç¨ãç¾ããç¨éã50ï¼
æå¹éã¨å¼ã³ã¾ãã. ・0.01→1.0E-2(1.0×1/10の2乗)→×1/100倍→÷100
æ¬ã®ãã¼ãæ ªã¨ããã®ã¯ãå½çãæ³¨ç®ã®æ°æè¡çã®ææã«ãã£ã¦æ³¨ç®ããããã¨ãç¹å¾´ã§ãããå®ã¯åå¿è
ããã«ã¯å°ã注æãå¿
è¦ã§ããããã§ã¯æ¬ã®ãã¼ãæ ªã®ãªã¹ã¯ã¨ç¹å¾´ããããããã解説ãã¦ã㾠⦠micï¼æå°çºè²é»æ¢æ¿åº¦ï¼ micï¼æå°çºè²é»æ¢æ¿åº¦ï¼ ç´°èãå¹é¤ããã¨å¢æ®ãã¾ãããã®æãæèè¬ã¨å
±ã«ç´°èãå¹é¤ããã¨ãè¬ã®ä½ç¨ã«ãã£ã¦ç´°èã®å¢æ®ãæãããã¾ãã ただ、水関係の装置は日頃のメンテナンスが重要でイオン交換樹脂とか水を貯めるタンク、蛇口に汚染がないかは確認する必要があります。
p=TDIST(t値,n-2,2)
2.得られた吸光度から、ブランクを差し引いて阻害率を求める式にあてはめて
対して、競合的拮抗薬では高濃度側へ平行移動する。. スポンサーリンク
・最初に『回帰分析』をここで説明するのは少し大変なので『E』のみ説明します。
癌細胞の増殖抑制実験をしています。 しかも、0.01と0.05, 0.1当たりの違いはグラフで書いて理解するのは困難だと思います IC50の単位として、ng/mlやnMといった単位が使われますが、
セルA1~A13に1~13の数字を入力、平均値=7、STDEVでは3.89444、STDEVPでは3.741657となります。
統計・確率には100%言い切れることはまずありません。というか100%言い切れるのなら統計・確率を使う必要は有りません。
ですので、対数軸を使います あるサイトで調べたところ、 データ点はある程度規則的に並んでいた方が良いですが、厳密に取る必要はないです 2012å¹´1æ4æ¥æ¾é ï½¢æèè¬ã®pk-pdï½£ æç¥å»ç§å¤§å¦å¤§å¦é¢ ææå¶å¾¡å¦ææ ä¸é´¨ å»£ç¹ æèè¬ã®pk-pdã¨ã¯ è¬ç©åæ
ãè§£æãããã¨ã«ããæèè¬ã®æå¹æ§ã¨å®å
¨æ§ãè©ä¾¡ããèãæ¹ã¯ãã¢ãã というのは理解できたのですが IC50はin vitro でEC50はin vivo のものだったような気がします^^; エクセルの統計関数で標準偏差を求める時、STDEVとSTDEVPがあります。両者の違いが良くわかりません。
本を読んだのですがいまいち難しくて分かりません。
阻害率(%)を出す
ということです。
バイオ、生化学系の実験に従事しているものですが「水」について教えて下さい。
そのとき、阻害物質(x軸)の濃度の振り方も異なってくるのでしょうか?
IC50は阻害実験、 という表現は何を意味しているのでしょうか?
すると、横軸に濃度、縦軸に効果を取ったグラフの場合、50%付近の効果が
r=0.90 (P<0.001)
参考にした文献には、対象となる酵素の量や濃度が書かれておらず、
・0.001→1.0E-3(1.0×1/10の3乗)→×1/1000倍→÷1000
よろしくお願い致します。, pは確率(probability)のpです。全く相関のない数字を組み合わせたときにそのr値が出る確率をあらわしています。
その死滅細胞(残存細胞:cell survival)を見ていると思います。その残存細胞の割合をMTT assayで評価しているのではないでしょうか・・・?
ãªã¼ãºã®ä»åã¯ããåçèªèåºæºã®ç´¯ç©çå½±é¿é¡ããããããããç°¡åã«è§£èª¬ãã¾ããã 2020å¹´10æ21æ¥ ã3ï¼ããã®ç¨®é¡ã¨åç§°ããæ´æ°ãã¾ããã 2020å¹´10æ12æ¥ ã5ï¼ä¿¡é ¼ã§ããæ
å ±ã¨çªå£ãã®é¢é£æ
å ±ã«ãæ¥æ¬çæ²»çå¦ä¼ ããæ²»çã®æ¡å
æ¿ å¤§äººã®ããè¬åº§ãã¸ã®ãªã³ã¯ãæ²è¼ãã¾ããã イオン交換法は酸性・強アルカリ性の樹脂を通し、イオン化合物を除く方法でこれを行った水がイオン交換水(脱イオン水)です。水の純度の評価には比抵抗を用いますが、およそ数百kΩ・cmの水が得られます。この段階で除けるのはイオン化合物だけで有機物・微生物は...続きを読む, ※各種外部サービスのアカウントをお持ちの方はこちらから簡単に登録できます。 これの意味がわかりません。
2.43×1/10000000000000000000となり、
・100→1.0E+2(1.0×10の2乗)→×100倍
1.1 ãã«ã¨ãªã¹ã»ã¡ã³ãã³ã®å¼ãæ±ããããã®2ã¤ã®ä»®å®; 1.2 åå¿éåº¦ãæ±ããããã«[es]ã«ã¤ãã¦è§£ã; 1.3 ããããåå¿åé度ã¨ã¯ä¸ä½ãã¤ã®é度ã®ãã¨ãªã®ã; 1.4 ãã«ã¨ãªã¹ã»ã¡ã³ãã³ã®å¼; 2 åå¿åé度ãåºè³ªæ¿åº¦ã«å¯¾ãã¦ãããããã¦ã¿ãã
これはキトトリオマイシンと読めばよいのでしょうか?
>P=0.05で相関がない
w/v%のwはg(グラム)でvは100mlです。, よろしくお願いします。
2.43×0.0000000000000000001だから、
(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); LD50/ED50の値が大きい薬物ほど、ED50とLD50に差があり、安全性の高い薬物といえる。, pA2とは、作動薬による用量-反応曲線を2倍だけ高濃度側に平行移動させるのに必要な競合的拮抗薬のモル濃度の-log値である。, pA2は競合的拮抗薬の効力を示す指標で、pA2の値が大きいほど効力が強いことになる。, 競合的拮抗薬は、「競合」からもイメージできるが、作動薬と受容体を取り合う。そのため、「用量-反応曲線を平行移動」となる。 ・E+数値は 10、100、1000 という大きい数を表します。
例えばサイコロを5回振って全て同じ目が出る確率は0.08%です。そんな時、そのサイコロを不良品(イカサマ?
それが危険率です。(この場...続きを読む, こんにちは。お世話になります。
(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); 薬に関わる全ての人に!『薬がみえる』が良書すぎて悔しい。薬理学の勉強におすすめ!もっと早くに買うべきだった。【レビュー】, 処方箋を写メって薬局に送るだけで薬が受け取れる「EPARKくすりの窓口」が便利!オンラインのネット受付で待ち時間が短縮できます。. またMS Excelを使ってのP値の計算方法を教えてください。
今回の実験をリニア(普通の)軸で取ると、一番右端が10になり左端が0.01≒0になります 文献中に「chitotriomycin」という言葉がでてくるのですが、
ic50 IC 50 㯠half maximal I nhibitory C oncentration ã§ããã æä¸ããè¬å¤ãä½ããé»å®³ inhibit ããã¨ãã«ã50% ã®å¹æãç¤ºãæ¿åº¦ ãæä¸éã§ããã å³ã®å³ï¼1ï¼ã¯ï¼ä¹³é
¸ lactate ãç¥çµ neuron ã®æ´»åï¼çºç« firing ï¼ãæå¶ãããã¨ã示ããå®é¨ã®çµæã§ï¼IC50 ã¨ã¨ãã«æãããåºã¦ããã¿ã¤ãã®å³ã§ããã
逆です。 補足お願いします。, オキシドールの成分に 過酸化水素(H2O2)2.5~3.5W/V%含有と記載されています。W/V%の意味が分かりません。W%なら重量パーセント、V%なら体積パーセントだと思いますがW/V%はどのような割合を示すのでしょうか。どなたか教えていただけないでしょうか。よろしくお願いいたします。, w/v%とは、weight/volume%のことで、2.5~3.5w/v%とは、100ml中に2.5~3.5gの過酸化水素が含有されているということです。
(たとえば10, 5, 2.5, 1.25, 0.625…のほうが良いとか)
どうすれば回帰分析が分かるようになるのでしょうか?
2ï¼æè¡å°æ¿è¬ã»æååºè¬ã®è¬çå¦ 5 2ï¼æè¡å°æ¿è¬ã»æååºè¬ã®è¬çå¦ å¿çæ¢å¡ãè³æ¢å¡ã¯ï¼è¡æµã®éãç°å¢ä¸ã§ã®è¡å°æ¿ã®æ´»æ§åã«ããåèè¡æ ã å平価説ã¨ã¯ï¼ ããããããã解説ãJã«ã¼ã广ã¨ã¯ï¼ 阻害率(%)を出す
これだけが理由というわけではないでしょうが。, こんにちわ。初めて投稿します。
よろしくお願いします。, ★回答
蒸留法は水を蒸留することで不純物を除く方法です。イオン交換法と組み合わせて2回蒸留することが一般的です。一般的な2次蒸留水の比抵抗は数MΩ・cmでバイオ・生化学関係には十分な純度です。動物培養細胞にも使用可能です。エンドトキシンも完全にフリーとまではいかないけれどもある程度の除去はできています。蒸留法は多くの不純物を除去可能ですが100度付近の沸点を持つ物質は除けません。
(リニア軸でいうと1, 1.6, 2, 2.6, 3, 3.6などでも良い) Original paperを見てないのとプラスミドのtransfectの手法が分からないので推測ですが・・・・。
これに関しては上で書いたように限外濾過膜で精製した水です。MilliQが当てはまるでしょう。(超純水も一般的には限外濾過をしているのでこれも当てはまりますかね。)
相関係数は0.90と計算された。相関がないのに偶然r=0.90 となる確率は0.001以下だと言ってます。
®ã¨ã®é¢ä¿ãã¨ã¯ã»ã«ã§ã®ã°ã©ãåã解説ï½ä¸çªåªãããå»è¬åéçºã«å¿
è¦ãªçµ±è¨å¦ã®ææ¬ ãã: 2019å¹´10æ7æ¥ 3:59 PM [â¦] ï¼ï¼ã¨ã¯ã»ã«ã§æ£è¦åå¸ãã°ã©ãåããï¼ ・『指数』って分かりますか?
2.得られた吸光度から、ブランクを差し引いて阻害率を求める式にあてはめて
つまり、全溶液100ml中に何gの薬液が溶けているか?
超純水は十数MΩ・cmの水のことです。MilliQはミリポア社の超純水装置を用いて作った水で比抵抗は15MΩ・cm以上と高純度の水です。MilliQに関してはイオン交換樹脂を通し、逆浸透法、限外濾過法を用いて精製しているようです。
IC50とは、50%阻害時に加えた酵素阻害剤の量/酵素の量なのかなと思うのですが、どうなのでしょう?
・最後に『回帰分析』とは何?下の『参考URL』をどうぞ。→『数学』カテゴリで質問してみては? ãã¤ã¢ã¹ããªã³ã¨ã¯ï¼ ã¾ãã¯ååã®ç±æ¥ããããã¾ãããã ãã¤ã¢ã¹ããªã³ 㯠Bayaspirin ã¨è¡¨è¨ãããã®ã§ãããããã¯è£½é 販売å
ã®ãã¤ã¨ã«ï¼ Bay erï¼ã¨ã¢ã¹ããªã³ï¼ aspirin ï¼ãçµã¿åããã¦å½åããã¦ãã¾ãã ä¸è¬åã¯ã¢ã¹ããªã³ã§ãã. というのが疑問になりました。 わかる方、回答よろしくお願いいたします。, >>Km値が大きくなるほど、親和性が上がるということでしょうか。 バイオ関係の論文(gene deliveryについて)を読んでいるのですが、IC50という言葉が出てきました。luciferase遺伝子をもつプラスミドをデリバリーポリマーに内包させ、BHK-21というセルに加えたという話なのですが、MTT(? ミカエリス定数はV=(Vmax・C)/(Km + C)で表されます。(Vは反応速度、Vmaxは最大反応速度、Cは基質濃度) ä½çã«ãiCloudãã¨ãPCï¼iTunesï¼ãã使ã£ã2éãã®ããã¯ã¢ããæ¹æ³ã«ã¤ãã¦ãããããå¿
è¦ãªè¨å®ãæé ãç»åä»ãã§è©³ãã解説ã
・最初に『回帰分析』をここで説明するのは少し大変なので『E』のみ説明します。
なってしまい、大きな誤差を生み出してしまいます。
なので、阻害物質の濃度をふって(10, 5, 1, 0.5, 0.1, 0.05, 0.01ug/mL)
エクセルでの計算ですが、まず関数CORRELを使ってr値を出します。xデータがA1からA10に、yデータがB1からB10に入っているとして
という風に行っていました。
実験書には必ずはじめのほうに書いてあることですので、pinokoBBさん自身でなにか実験書をご参照ください。, pinokoBBさん、こんにちは。
)と結論つけるとわずかに間違っている可能性が残っています。ただ、それが5%以下ならp=0.05でそのサイコロは正常ではないと結論付けます。
ã«æ
£ãã¦ãã¾ãããã ãã®å¼ãã±ã£ã¨è¦ãã ãã§ã¯ãæå³ãããããããªãã§ãããããã®å¼ã説æããã¨ã次ããã«ãªãã¾ãã
アドバイスよろしくお願いします。.
5åã§ããããã©ã³ã½ã¯ã»ã±ãã¼ã®ãçµæ¸è¡¨ã â ãããããã解説 輸åºå¥¨å±éå¶åº¦ã¯å½ãè²§ãããã. なので、阻...続きを読む, どんなグラフなのかわからないのであれですが 0.000000000000000000243という数値を意味します。
したがって、45%阻害、50%阻害も、55%阻害というように、多少ぶれても、
水道水、脱イオン水、MilliQ、蒸留水(二段蒸留水)、超純水の違いを教えて下さい。
Eとは何でしょうか?
・よって、『2.43E-19』とは?
そこに阻害剤を加え、50%阻害時の量を分子にして、IC50を求めるのでしょうか?
よろしくお願いいたします。, pinokoBBさん、こんにちは。
æ ¹æµå½æ¨©ã¨ã¯ï¼ããããããç°¡åã«è§£èª¬ãã¾ãã.
Anime Movies. 論文を読んでいて、IC50というものを初めて知ったのですが、
ですので今回の濃度のままで問題ないと思います, IC50(50%阻害濃度)についてなんですが、何で50%で評価するんでしょうか?100%や90%阻害濃度では、不都合がありますか?図書館や、ネットで調べてみたんですけど、なぜ50%なのかがわかりません。どなたか教えて下さい。, 一般に、濃度に対する効果の曲線は、シグモイドと呼ばれる形に近くなることが多いようです。(阻害に限らず、薬効や毒性なども)
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